En 2019 Taiju, un lycéen comme les autres, annonce à son meilleur ami Senku, un génie des sciences, qu'il est sur le point de révéler ses sentiments à Yuzuriha, une fille dont il est secrètement amoureux depuis quelques années. Alors que le jeune homme s'apprête à déclarer sa flamme, une lumière verte brillante apparaît dans le ciel et transforme toute l'humanité en statues de pierres. Lorsque Taiju réussit finalement à se libérer grâce à l'aide de son meilleur ami Senku, il se retrouve face à un monde complètement différent où la nature a repris ses droits